マスの右上の枠におさまるように書くと、正しく認識されますのでお試しください。
縦書きの「ひらがな・カタカナの小さい文字（ゃ、ゅ、ょ、っ、ャ、ュ、ョ、ッ）」は、マスの右上の枠に書くのが正しい書き方です。